Cáncer de próstata: Big Data desbloquea 80 nuevos objetivos farmacológicos
En el estudio más grande para analizar la genética del cáncer de próstata, los científicos encontraron no menos de 80 nuevos objetivos farmacológicos potenciales. El proyecto abre amplias avenidas para el diseño de nuevos tratamientos.
La extracción de datos genéticos fue, una vez, una tarea engorrosa e increíblemente lenta.
Sin embargo, a medida que la tecnología continúa mejorando, el trabajo se ha vuelto significativamente más rápido y más barato.
Paralelamente, las herramientas disponibles para manejar grandes conjuntos de datos han mejorado enormemente.
En conjunto, esto significa que los océanos de información recolectada del código genético se pueden analizar, mapear y combinar con relativa facilidad para proporcionar un nuevo nivel de claridad.
Recientemente, un equipo internacional utilizó este enfoque de doble vertiente de análisis de ADN y big data para profundizar en la genética del cáncer de próstata. En busca de grietas moleculares en la armadura de la enfermedad, la investigación fue orquestada por el Instituto de Investigación del Cáncer de Londres, Reino Unido.
Desafíos del cáncer de próstata
El cáncer de próstata es el segundo cáncer más común entre los hombres en los Estados Unidos. Este año, en los EE. UU., Se estima que habrá 164,690 nuevos casos de cáncer de próstata y casi 30,000 muertes a causa de la enfermedad.
Aunque los investigadores han avanzado en la comprensión y el tratamiento del cáncer de próstata, todavía existen varias dificultades.
Como explica la líder del estudio, la profesora Rosalind Eeles, "Uno de los desafíos que enfrentamos en la investigación del cáncer es la complejidad de la enfermedad y la gran cantidad de formas en que podríamos tratarla".
La Dra. Justine Alford, de Cancer Research U.K., describe otro tema en el estudio e intervención del cáncer de próstata.
"Un obstáculo importante para seguir avanzando contra el cáncer de próstata", explica, "es la falta de formas de predecir con precisión cómo progresará la enfermedad de una persona, lo que dificulta saber qué tratamiento es el mejor para cada paciente".
Recolectando datos genéticos
Para abordar el problema desde una nueva dirección, los investigadores tomaron información genética de 112 hombres con cáncer de próstata y la combinaron con datos de una variedad de otros estudios. En total, se utilizaron muestras de 930 pacientes.
Utilizando las últimas técnicas de big data, el equipo obtuvo nuevos conocimientos sobre los cambios genéticos que desencadenan el desarrollo y alimentan el progreso del cáncer de próstata. Una vez que entendieron qué genes estaban involucrados, pudieron crear un mapa de las proteínas codificadas por estos genes.
A continuación, recurrieron a una base de datos llamada canSAR, que combina datos de estudios, aplica el aprendizaje automático y ayuda a proporcionar información sobre el descubrimiento de fármacos.
En su sitio web, canSAR explica las preguntas que su base de datos pretende responder: “¿Qué se sabe sobre una proteína, en qué cánceres se expresa o muta, y qué herramientas químicas y modelos de líneas celulares se pueden utilizar para probar experimentalmente su actividad? ¿Qué se sabe acerca de un fármaco, su perfil de sensibilidad celular y qué proteínas se sabe que se une que pueden explicar una bioactividad inusual? "
Los científicos descubrieron que 80 de las proteínas que habían descubierto eran posibles objetivos farmacológicos. Y, 11 de estos fueron el objetivo de los medicamentos existentes, y otros siete podrían ser el objetivo de los medicamentos que ya se encuentran en ensayos clínicos.
Sus hallazgos se publican esta semana en la revista Genética de la naturaleza.
“Nuestro estudio aplicó técnicas de vanguardia en el análisis de macrodatos para desbloquear una gran cantidad de información nueva sobre el cáncer de próstata y las posibles formas de combatir la enfermedad”.
Prof. Rosalind Eeles
Mirando hacia el futuro
Los descubrimientos requerirán más estudios antes de que puedan usarse clínicamente, por supuesto, pero brindan una gama de nuevas posibilidades.
Como explica el coautor, el profesor Paul Workman, “este estudio ha descubierto una gran cantidad de genes nuevos que impulsan el desarrollo del cáncer de próstata y nos ha brindado información vital sobre cómo aprovechar la biología de la enfermedad para encontrar posibles nuevos tratamientos. "
Espera que su trabajo "estimule una ola de nuevas investigaciones sobre los cambios genéticos y los posibles objetivos farmacológicos que [ellos] han identificado, con el objetivo de que los pacientes se beneficien lo antes posible".
Otro obstáculo para el diseño de tratamientos para el cáncer de próstata es la forma en que la enfermedad progresa de manera diferente en cada individuo. Esto hace que sea mucho más difícil decidir qué opciones de tratamiento se adaptan mejor a cada paciente.
El Dr. Alford espera que “[d] ejo de mejorar enormemente nuestra comprensión de la genética detrás de la enfermedad, […] en el futuro, este conocimiento podría ayudar a los médicos a adaptar mejor los tratamientos al cáncer de un individuo y, con suerte, ver más personas sobrevivir a su enfermedad. "
Estos son los primeros días, pero los hallazgos que surgirán de la próxima generación de estudios podrían ser transformadores para el campo.
